Eur J Endocrinol：石蜡标本基因表达组分析在肾上腺皮质癌诊断和预后中的价值

故事情节：功能性腺肿瘤(ACC)是一种相像的内腺体肿瘤(每年每百万利是有1-2事例)，基本上高血压极低。临床对疾变管理者至关不可忽视，但由于这种传染疾的相像，临床很紧迫。事实上，在功能性腺(ACT)里面，ACC是相像的，大多数是功能性腺腺瘤(ACA)。疾因恶功能性平均分称为Weiss平均分，最惯用于临床。然而，不具备里面等平均分和相像小组织学变异的不容易被归纳。同样是，考虑到由大线粒体和马氏溶解微粒小组成的马氏溶解变异体的恶功能性是不具备娱乐功能性的。

ACC的5年基本上生存率一般低于40%，但异质功能性。高血压分层对督导化疗决策很不可忽视，得益于辅助化疗。外科上应用于的主要高血压因素是仍须Ki-67抑制指数。其他高血压因素举例来说还包括皮质醇腺体和年龄。

以前的性状小组科学研究指出，性状小组发生变化集里面在并不相同的分子会亚DF。性状表达小组著者是分子会归纳的核心内容。性状表达小组著者将功能性腺腺瘤与肿瘤第一区分出去，并鉴定显现出两小组与高血压密切相关的ACC：“C1a”亚小组，其抑制性状过度表达，高血压妨碍；“C1B”亚小组，不具备免疫基本特征，高血压较好。从性状表达小组基本特征，已推断显现出特定的mRNA标有，如BUB1BPINK1的差异性状表达。这些抗疾毒标有物强化了ACC的临床和高血压评估。然而，到目前为止，性状表达小组著者及其抗疾毒替代标有物之外高质量的RNA，需要高质量的冰冻小组织样品。在正因如此实践里面，获取这种类DF的工艺决定很高，而对于ACC疾变来说，往往无法发挥作用。

近期的3’RNA核酸核心技术释放出来并核酸了多激酶化RNA 3’前端的短基本版，这些基本版不太容易被RNA交联。与性状表达molecular或新标准的北前端RNA核酸并不相同，这种核心技术只需要少量和低质量的RNA，与有效成份浮动碳化包埋(FFPE)样品兼容。

借此：主要借此是并用新的3’前端RNA核酸核心技术，考虑到有效成份浮动碳化包埋(FFPE)样品的性状表达小组著者。第二个借此是通过信息化科学研究相像的马氏酸线粒体ACT比如说，展示这种核心技术探索大DFFFPE资料库的技能。

方法有：我们设为131事例ACT：来自科钦养老院的培训数据流和来自维尔茨堡养老院的独立验证数据流。用QuantSeq(Lexogen)和NextSeq500(Illumina)从FFPE样品里面消除3’性状表达小组。

结果：在培训数据流里面，无监督聚类鉴别显现出3小组：“C1A”DF摧残功能性肿瘤(N=28，29%)、“C1B”DF肿瘤(N=28，29%)和“C2”DF腺瘤(N=39，41%)。FFPE性状表达小组的高血压经济效益在验证数据流里面得到证实(5年OS：C1a小组为26%(N=26)，C1B小组为100%(N=10)，p=0.003)。在还包括仍须和Ki-67的多数据类DF假设里面，FFPE性状表达小组是一个独立的高血压因素(OS-HR 7.5，p=0.01)。马氏溶解粒线粒体ACT(N=19)未形成任何特异簇。马氏酸线粒体肿瘤(N=6)和恶功能性想像力未明的马氏溶解线粒体肿瘤(N=4)均为“C1B”。

图1.培训数据流里面ACT的FFPE性状表达小组归纳A.基于2000个最易变的性状对ACT的非监督归纳考虑到了三个主要小组，互换于“C1A”摧残功能性肿瘤、“C1B”惰功能性肿瘤和“C2”腺瘤。B.用于转化成非监督归纳的3个非负标量裂解(NMF)层次的热图。孕酮(肾上腺分化)、抑制和免疫征象在每种ACT里面的表达。D.三小组性状表达小组里面差异最很大的前50个性状的表达谱。即通过迭代聚类解法说明样品中间的相似度的一致功能性标量。行和列是疾变样品。深思熟虑标量值的范围从0(从不聚在一起)到1(无论如何聚在一起)。

图2.并不相同第一区域的FFPE性状表达小组归纳。对培训数据流里面5名疾变的两个并不相同第一区域进行苏木精/伊红/系列赛蒂尔染色(放大40倍)，其里面一个为摧残功能性(-a)第一区，一个为非摧残功能性(-b)第一区。黑条均是由50微米。黑色箭头说明有丝分裂。紫色箭头说明不典DF的有丝分裂。B.描述为5名疾变采样的两个并不相同的第一区域，其里面一个是摧残功能性(-a)，另一个是摧残功能性(-b)。患病用：Fuhrman核级患病用于马氏溶解线粒体。C.基于PCA的两个主成份(Dim1、Dim2)的样品投影基于培训数据流的95个独特疾变里面的2000个最可视性状。来自培训数据流的样品看显现出为性状表达小组高中学生图例的含糊方格。来自两个并不相同第一区域的8名疾变的样品按疾变的颜色看显现出为仅有五边形。

图3.ACC验证数据流里面的FFPE性状表达小组归纳和高血压A.样品投影基于PCA的两个主成份(Dim1，Dim2)，基于培训数据流里面95个独特疾变里面最可视的2000个性状。来自培训数据流的样品看显现出为性状表达小组高中学生图例的含糊方格。来自验证数据流的样品以性状表达小组类别图例的基本五边形说明。B.根据验证数据流里面I-III期ACC疾变的数据分析性状表达小组类DF进行无疾生存。根据验证数据流的I-IV期ACC疾变的数据分析性状表达小组归纳，总的存活率。

论证：3’RNA核酸法值得注意FFPE样品里面考虑到ACT分子会类DF的一种简便方法有。这项核心技术一定会有助于正因如此应用于和大DF简介科学研究。

原文显现出处：Jouinot A, Lippert J, Sibony M,et al.Transcriptome in paraffin samples for the diagnosis and prognosis of adrenocortical carcinoma.Eur J Endocrinol 2022 Mar 01